Po přiložení aplikátoru na ošetřovanou oblast se vytvořeným podtlakem nasaje do aplikátoru povrchový tuk. Vytvořené vakuum dočasně omezí průtok krve v nasáté tkáni a umožní lokální řízené zmražení tukové vrstvy na teplotu poškozující jen tukové buňky a bezpečnou pro ostatní tkáň.
Po kryolipolýze je tuk přirozeným způsobem odplavován lymfatickým systémem. Rozpad tukových buněk probíhá postupně během 2 měsíců a tak není organismus nijak extrémně zatěžován.